Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cep55Q8BT07 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cep55Q8BT07 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cep55Q8BT07 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms