Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E130116L18RikQ8BMV6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130116L18RikQ8BMV6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms