Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hirip3Q8BLH7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hirip3Q8BLH7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hirip3Q8BLH7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms