Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem87bQ8BKU8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem87bQ8BKU8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem87bQ8BKU8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem87bQ8BKU8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem87bQ8BKU8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem87bQ8BKU8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem87bQ8BKU8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms