Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan12Q8BKT6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan12Q8BKT6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan12Q8BKT6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan12Q8BKT6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan12Q8BKT6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan12Q8BKT6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan12Q8BKT6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan12Q8BKT6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tspan12Q8BKT6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tspan12Q8BKT6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tspan12Q8BKT6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms