Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnrc6bQ8BKI2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnrc6bQ8BKI2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnrc6bQ8BKI2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms