Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rufy1Q8BIJ7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rufy1Q8BIJ7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms