Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Bhlhe23Q8BGW3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe23Q8BGW3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms