Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrtm2Q8BGA3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms