Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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H2-M10.4Q85ZW8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M10.4Q85ZW8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.4Q85ZW8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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