Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc50Q810U5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc50Q810U5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms