Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc172Q810N9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc172Q810N9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc172Q810N9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms