Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrrc1Q80VQ1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms