Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc29Q80VM3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc29Q80VM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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