Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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RubcnQ80U62 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnQ80U62 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnQ80U62 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RubcnQ80U62 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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RubcnQ80U62 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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RubcnQ80U62 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnQ80U62 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnQ80U62 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnQ80U62 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RubcnQ80U62 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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RubcnQ80U62 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RubcnQ80U62 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RubcnQ80U62 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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RubcnQ80U62 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RubcnQ80U62 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RubcnQ80U62 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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RubcnQ80U62 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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RubcnQ80U62 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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RubcnQ80U62 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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RubcnQ80U62 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RubcnQ80U62 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RubcnQ80U62 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
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