Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cul9Q80TT8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cul9Q80TT8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cul9Q80TT8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cul9Q80TT8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms