Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phf8Q80TJ7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf8Q80TJ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf8Q80TJ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms