Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ube2q1Q7TSS2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ube2q1Q7TSS2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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