Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smim12Q78RX3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smim12Q78RX3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms