Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nme8Q715T0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nme8Q715T0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nme8Q715T0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms