Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sned1Q70E20 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sned1Q70E20 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sned1Q70E20 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms