Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NinlQ6ZQ12 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NinlQ6ZQ12 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
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