Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc88cQ6VGS5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc88cQ6VGS5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms