Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Shc4Q6S5L9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Shc4Q6S5L9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms