Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt9Q6RHW0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt9Q6RHW0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt9Q6RHW0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms