Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIU9

Uncharacterized protein FLJ45252 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PIU9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6PIU9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6PIU9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q6PIU9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6PIU9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms