Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NfrkbQ6PIJ4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NfrkbQ6PIJ4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NfrkbQ6PIJ4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms