Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc82Q6PG04 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc82Q6PG04 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc82Q6PG04 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms