Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CtifQ6PEE2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtifQ6PEE2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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