Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Herc4Q6PAV2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Herc4Q6PAV2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Herc4Q6PAV2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms