Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BcrQ6PAJ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BcrQ6PAJ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BcrQ6PAJ1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms