Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp49Q6P9L4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp49Q6P9L4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp49Q6P9L4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms