Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fam222bQ6P539 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam222bQ6P539 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam222bQ6P539 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms