Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thsd7bQ6P4U0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thsd7bQ6P4U0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thsd7bQ6P4U0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thsd7bQ6P4U0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thsd7bQ6P4U0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thsd7bQ6P4U0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Thsd7bQ6P4U0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Thsd7bQ6P4U0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Thsd7bQ6P4U0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Thsd7bQ6P4U0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thsd7bQ6P4U0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thsd7bQ6P4U0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thsd7bQ6P4U0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms