Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Podnl1Q6P3Y9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Podnl1Q6P3Y9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Podnl1Q6P3Y9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms