Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac10Q6P3E7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdac10Q6P3E7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms