Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrimpolQ6P1E7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrimpolQ6P1E7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrimpolQ6P1E7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms