Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptpdc1Q6NZK8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ptpdc1Q6NZK8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ptpdc1Q6NZK8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms