Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Taf9bQ6NZA9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Taf9bQ6NZA9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Taf9bQ6NZA9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms