Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cpsf6Q6NVF9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cpsf6Q6NVF9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms