Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HelbQ6NVF4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HelbQ6NVF4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HelbQ6NVF4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms