Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2810408A11RikQ6NSU2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms