Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt40Q6IFX3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt40Q6IFX3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt40Q6IFX3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
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