Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nckap5lQ6GQX2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nckap5lQ6GQX2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Nckap5lQ6GQX2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms