Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pdzrn3Q69ZS0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms