Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Jmjd1cQ69ZK6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd1cQ69ZK6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms