Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrcc1Q69ZB0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrcc1Q69ZB0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrcc1Q69ZB0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.1 ms