Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY9

BC080695, cDNA sequence BC080695, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC080695Q66JY9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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BC080695Q66JY9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC080695Q66JY9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BC080695Q66JY9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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BC080695Q66JY9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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BC080695Q66JY9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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BC080695Q66JY9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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BC080695Q66JY9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BC080695Q66JY9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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BC080695Q66JY9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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BC080695Q66JY9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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BC080695Q66JY9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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BC080695Q66JY9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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BC080695Q66JY9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BC080695Q66JY9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms