Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nhlh2Q64221 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nhlh2Q64221 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms