Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl12Q62401 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccl12Q62401 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms